1、形式不同。進料加工需要企業自己從國外購進材料進行加工。需要自身承擔貨物銷售風險，來料加工則是受托，由對方提供材料，本企業只負責進行加工。

2、所有權歸屬不同。進料加工，在貨物交付之前，所有權都屬于加工企業。來料加工，由于材料由對方提供，所以加工企業本身不具有所有權。

3、稅收執行上不同。進料加工企業按免抵退方法執行。來料加工出口貨物實行免征增值稅、消費稅。