這首先要從這兩種考試的差異談起：注冊會計師(CPA)考試是注冊會計師協會組織的注會執業資格的考試，2015年11月20日開始報名的稅務師(TA)考試是稅務師協會組織的稅務師職業資格的考試。執業資格與職業資格一字之差，前者是準入考試，后者是水平考試。 
 
專業性差異 
 
在涉稅領域，稅務師更具有專業性。并且CPA考試與TA考試存在專業的差異，這種專業的差異也帶來了稅法考試命題上的差異。注冊會計師考試的主科是會計和審計，稅法在CPA考試中以一個科目出現，而且屬于副科。稅務師稅法考試的主科就是稅法Ⅰ、稅法Ⅱ、涉稅服務實務這三科，其中稅法Ⅰ包括了我國商品勞務稅的各個稅種，這些稅種的計稅依據與銷售額、勞務服務額等流轉額直接相關，而稅法Ⅱ包括了我國所得稅、財產稅、特定行為稅的稅種，計稅依據與所得額、財產價值或數量以及財產收益等等相關。涉稅服務實務科目則涵蓋稅收程序法、涉稅會計、納稅申報具體操作、納稅檢查、稅務代理等內容。 
 
執業目的差異 
 
注冊會計師的財務審計，是依據會計法律、法規，對被審計單位財務報表是否真實和公允發表意見，其執業行為的目的是對股東等投資者負責。稅務師的涉稅鑒證是依據稅收法律、法規，對被鑒證單位涉稅事項的真實性、合法性發表意見，從而為稅收征納雙方提供合法、準確的涉稅信息，其執業行為的目的是對國家稅收利益和納稅人合法權益負責。 
 
由于執業目的不同，注冊會計師同時提供“審計業務”和“非審計業務”,可能會造成審計質量的下降。根據管理學原理，管理決策行為與管理決策評價要進行比較恰當的分離，因為管理者很難對自身的決策行動效果作出公正和客觀的評價；同樣，如果注冊會計師從事非審計服務中的管理咨詢服務，則很容易置身于企業管理者的位置，導致其審計工作難以客觀、公正。