在用友軟件中為建筑公司的多個工程項目設置輔助核算，可以按照以下步驟進行操作：

進入基礎設置，選擇財務會計科目。例如，找到1604在建工程科目，雙擊進入。
在輔助核算選項中，勾選“項目核算”，并點擊確定。
返回到主界面，進入基礎設置的財務模塊，點擊“項目目錄”選項。
點擊“增加”按鈕，開始定義項目。根據實際情況選擇項目性質類別和大類名稱，并設置項目的級次。
完成以上步驟后，即可為在建工程科目設置項目輔助核算。

此外，針對用友軟件的使用，可以尋找相關的課程進行學習。可以在在線教育平臺、培訓機構或用友軟件的官網上查找，學校目前主要是針對的金蝶的用戶