老師，您好！  
據我所知，在你把發票改成普票并已經開給對方的情況下，你的可能會面臨的問題可能是：財務會科或者財政部門可能不認可發票的開具及抵扣，從而導致發票不能獲得稅收優惠；或者由于專用發票轉換成普通發票，對方可能會拒絕接受，無法使用。  
因此，建議你最好咨詢一下財務會計和稅務部門，尋求他們的專業意見，依法辦事，以免造成不必要的后果。