小規模納稅人的工會經費是按季度繳納的。根據《中華人民共和國企業所得稅法》，所得稅納稅人應按季度繳納企業所得稅，每季度繳納一次。工會經費也需按季度繳納，但是根據國家規定，凡是從一個月到三個月為一個季度，超過三個月的，應當另外加繳一季度的工會經費。 
 
拓展知識：此外，根據《中華人民共和國企業所得稅法》的規定，中小企業可以根據自身實際情況，選擇繳納企業所得稅的季度稅款。實際上，繳納工會經費的季度也可以由企業自主選擇，一般是以繳納企業所得稅的季度為準，繳納工會經費也按照相同的季度繳納。 
 
應用案例：例如，蘇州市某小規模企業在2018年1月-3月期間，需要繳納企業所得稅，這時，它也需要按季度繳納工會經費。又如，某小規模企業在2018年4月-6月期間，需要繳納企業所得稅，那么它就需要同時繳納當季度和前一季度的工會經費。